Исследование транскриптома единичных ядросодержащих эритроидных клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени ⋆ Вестник аллерголога-иммунолога
lay Исследование транскриптома единичных ядросодержащих эритроидных клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени

Исследование транскриптома единичных ядросодержащих эритроидных клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени

Автор: Перик-Заводский Роман Юрьевич

Соавторы: Перик-Заводская О. Ю., Шевченко Ю. А., Алрхмун С., Сенников С. В., Денисова В. В., Зайцев К. В.

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт фундаментальной и клинической иммунологии»; Клиника иммунопатологии, ФГБНУ «Сибирский федеральный научно-клинический центр Федерального медико-биологического агентства»

Россия, Новосибирск, Томск

Актуальность. Эритроидные ядросодержащие клетки (ЭЯК) являются предшественниками эритроцитов, для которых показаны выраженные иммуносупрессивные свойства, которые реализуются через продукцию АФК, фермента Аргиназа-2 и ТФР-бета. Экспансия ЭЯК наблюдается при множестве социально-значимых заболеваний, таких как COVID-19, в патогенезе которых возникает анемия. Детальное изучение иммунотранскриптома единичных ЭЯК позволит лучше понимать природу иммуносупрессии, вызываемой ЭЯК.

Цель: определение транскрипционного профиля единичных эритроидных клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени.

Материалы и методы. Из суспензии клеток костного мозга, пуповинной крови и гомогенизированной паренхимы фетальной печени методом центрифугирования в градиенте плотности FicollTM были выделены мононуклеарные клетки. Мононуклеарные клетки были отсортированы при помощи позитивной магнитной сортировки по CD235a с целью получения ЭЯК. CD235a+ ЭЯК костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени загружены в аппарат BD Rhapsody Express, в котором было произведено добавление улавливающих мРНК магнитных бус, лизис клеток и гибридизация мРНК с магнитными бусами. мРНК затем была обратно транскрибирована с получением кДНК. кДНК была амплифицирована в трех раундах ПЦР с целью получения финальных библиотек. Полученные библиотеки были пулированы и секвенированы на приборе NextSeq550. Полученные FASTQ файлы были обработаны при помощи пайплайна BD версии 1.9 с целью получения финальных метрик. Финальные метрики были проанализированы в SeqGeq 1.6.

Результаты. В ЭЯК костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени была обнаружена экспрессия генов ARG1, CXCL5, CXCL8, DEFA3, DEFA4, IL1B, IL15, IL18, IGHE (секретируемый), LGALS3, LGALS9, TGFB3 and VEGFA. Только в ЭЯК из фетальной печени была обнаружена экспрессия IL33.

Выводы. Нами была обнаружена экспрессия таких ранее не описанных для ЭЯК человека иммуносупрессорных молекул, как DEFA3, LGALS3 и LGALS9, среди которых экспрессия LGALS3 присутствовала в 90% ЭЯК. Эти данные позволяют предположить иммуносупрессию не только по средствам ферментативного разрушения аргинина аргиназой-1, но и контактный механизм иммуносупрессии через галектин-3 и галектин-9, а также гуморальный механизм через бета-дефензин 3.

Финансирование. Работа была выполнена при поддержке РНФ, номер соглашения 21-15-00087, https://rscf.ru/project/21-15-00087/.

Комментарии (0)

Читайте также

layК вопросу о фенотипах бронхиальной астмы

К вопросу о фенотипах бронхиальной астмы

Автор: Казимирова Ольга Васильевна

Соавторы: Югай М. Н., Вейсенберг Т. В., Финогенова А. Д.

НАО «Медицинский университет Караганды»

Казахстан, Караганда

Актуальность. Кашлевой...

22.07.2022
211 0
layВлияние на качество жизни пациентов с аллергическим ринитом сочетание АСИТ и подземной спелеотерапии

Влияние на качество жизни пациентов с аллергическим...

Автор: Санникова Наталья Николаевна

Учреждение здравоохранения «Солигорская центральная районная больница»; Государственное учреждение «Республиканская больница спелеолечения»

Беларусь,...

22.07.2022
123 0

Новости

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ

Статьи

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ

Мероприятия

ВСЕ МЕРОПРИЯТИЯ

Пациентам

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ

Газета

Авторы номера
  • Автор: Латышева Татьяна Васильевна

    Доктор медицинских наук, профессор, руководитель отделения интенсивной терапии и реанимации клиники ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России, профессор кафедры клинической аллергологии и иммунологии ФДПО ФГБОУ ВО МГМСУ им. А.И. Евдокимова...

  • Автор: Латышева Елена Александровна


    Доктор медицинских наук, заведующая отделением иммунопатологии клиники ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России, доцент кафедры клинической иммунологии факультета МБФ ФГАОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России

  • Автор: Родина Юлия Александровна


    Кандидат медицинских наук, врач аллерголог-иммунолог, старший научный сотрудник отдела оптимизации лечения иммунодефицитов ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России

  • Автор: Мухина Анна Александровна


    Врач аллерголог-иммунолог, сотрудник консультативного отделения ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России

ВСЕ АВТОРЫ

База знаний

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ
Этот сайт использует файлы cookie. Продолжая просматривать сайт, вы подтверждаете, что были проинформированы об использовании файлов cookie сайтом и согласны с нашими условиями обработки и хранения персональных данных.
Подтвердить
Отклонить
Этот сайт использует файлы cookie. Продолжая просматривать сайт, вы подтверждаете, что были проинформированы об использовании файлов cookie сайтом и согласны с нашими условиями обработки и хранения персональных данных.
Подтвердить
Отклонить