lay Исследование транскриптома единичных ядросодержащих эритроидных клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени

Исследование транскриптома единичных ядросодержащих эритроидных клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени

Автор: Перик-Заводский Роман Юрьевич

Соавторы: Перик-Заводская О. Ю., Шевченко Ю. А., Денисова В. В., Терещенко В. П., Алрхмун С., Зайцев К. В., Сенников С. В.

Лаборатория молекулярной иммунологии, ФГБНУ «Научно-исследовательский институт фундаментальной и клинической иммунологии»; ФГБНУ «Сибирский федеральный научно-клинический центр Федерального медико-биологического агентства»

Россия, Новосибирск, Томск

Актуальность. Эритроидные ядросодержащие клетки (ЭЯК) являются предшественниками эритроцитов, для которых показаны выраженные иммуносупрессивные свойства, которые реализуются через продукцию АФК, фермента Аргиназа-2 и ТФР-бета. Экспансия ЭЯК наблюдается при множестве социально-значимых заболеваниях, таких, как COVID-19, в патогенезе которых возникает анемия. Детальное изучение иммунотранскриптома единичных ЭЯК позволит лучше понимать природу иммуносупрессии, вызываемой ЭЯК.

Цель: определение транскрипционного профиля единичных эритроидных клеток, клеток костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени.

Материалы и методы. Из суспензии клеток костного мозга, пуповинной крови и гомогенизированной паренхимы фетальной печени методом центрифугирования в градиенте плотности FicollTM были выделены мононуклеарные клетки.

Мононуклеарные клетки были отсортированы при помощи позитивной магнитной сортировки по CD235a с целью получения ЭЯК. CD235a+ ЭЯК костного мозга пуповинной крови и фетальной печени загружены в аппарат BD Rhapsody Express, в котором было произведено добавление улавливающих мРНК магнитных бус, лизис клеток и гибридизация мРНК с магнитными бусами. мРНК затем была обратно транскрибирована с получением кДНК. кДНК была амплифицирована в трех раундах ПЦР с целью получения финальных библиотек. Полученные библиотеки были пулированы и секвенированы на приборе NextSeq550. Полученные FASTQ файлы были обработаны при помощи пайплайна BD версии 1.9 с целью получения финальных метрик. Финальные метрики были проанализированы в SeqGeq 1.6.

Результаты. В ЭЯК костного мозга, пуповинной крови и фетальной печени была обнаружена экспрессия генов ARG1, CXCL5, CXCL8, DEFA3, DEFA4, IL1B, IL15, IL18, IGHE (секретируемый), LGALS3, LGALS9, TGFB3 and VEGFA. Только в ЭЯК из фетальной печени была обнаружена экспрессия IL33.

Выводы. Нами была обнаружена экспрессия таких ранее не описанных для ЭЯК человека иммуносупрессорных молекул, как DEFA3, LGALS3 и LGALS9, среди которых экспрессия LGALS3 присутствовала в 90% ЭЯК. Эти данные позволяют предположить иммуносупрессию не только по средствам ферментативного разрушения аргинина аргиназой-1, но и контактный механизм иммуносупрессии через галектин-3 и галектин-9, а также гуморальный механизм через бета-дефензин 3. Финансирование. Работа была выполнена при поддержке РНФ, номер соглашения 21-15-00087, https://rscf.ru/project/21-15-00087/.

Комментарии (0)

Читайте также

layК вопросу о фенотипах бронхиальной астмы

К вопросу о фенотипах бронхиальной астмы

Автор: Кизимирова Ольга Васильевна

Соавторы: Югай М. Н., Вейсенберг Т. В., Финогенова А. Д.

НАО «Медицинский университет Караганды»

Казахстан, Караганда

Актуальность. Кашлевой...

22.07.2022
59 0
layВлияние на качество жизни пациентов с аллергическим ринитом сочетание АСИТ и подземной спелеотерапии

Влияние на качество жизни пациентов с аллергическим...

Автор: Санникова Наталья Николаевна

Учреждение здравоохранения «Солигорская центральная районная больница»; Государственное учреждение «Республиканская больница спелеолечения»

Беларусь,...

22.07.2022
50 0

Новости

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ

Статьи

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ

Мероприятия

ВСЕ МЕРОПРИЯТИЯ

Пациентам

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ

Газета

Авторы номера
  • Автор: Данилычева Инна Владимировна


    кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник отделения аллергологии и иммунотерапии ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России.

  • Автор: Смолкин Юрий Соломонович

    доктор медицинских наук, профессор кафедры клинической иммунологии и аллергологии Академии постдипломного образования ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, вице-президент Общероссийской общественной организации «Ассоциация детских аллергологов и иммунологов...

  • Автор: Мешкова Раиса Яковлевна

    доктор медицинских наук, профессор, заслуженный врач Российской Федерации, главный внештатный аллерголог-иммунолог департамента Смоленской области по здравоохранению, заведующая кафедрой клинической иммунологии и аллергологии Смоленского...

ВСЕ АВТОРЫ

База знаний

ЧИТАТЬ ДАЛЕЕ
Этот сайт использует файлы cookie. Продолжая просматривать сайт, вы подтверждаете, что были проинформированы об использовании файлов cookie сайтом и согласны с нашими условиями обработки и хранения персональных данных.
Подтвердить
Отклонить